Compositeur et chef d’orchestre allemand, Matthias Pintscher étudie le piano, la percussion et le violon puis la direction d’orchestre et dirige très tôt l’orchestre des jeunes de sa ville. Cette expérience affermit son goût pour la musique orchestrale et se retrouve dans ses premières œuvres, marquées par la dimension symphonique.
Après un voyage d’études à Londres en 1988, il suit les cours de composition de Giselher Klebe à la Hochschule für Musik de Detmold. En 1990, il rencontre Hans Werner Henze et étudie, de 1992 à 1994, avec Manfred Trojahn à Düsseldorf.
De nombreuses bourses d’étude et résidences jalonnent un parcours exceptionnellement rapide et fécond sur le plan créatif. Pintscher est l’auteur de deux opéras : Thomas Chatterton (1994-98), L’espace dernier (2004) sur un livret qu’il écrit lui-même d’après et avec des textes d’Arthur Rimbaud, ainsi qu'un ballet Gesprungene Glocken (1992-1993, révisé en 2000). Dans ses pièces instrumentales également, une sorte de « théâtre imaginaire » est représenté : Allegoria sonora, per un violoncello e gruppo stumentale (1992), Fünf Orchesterstücke (1997) ou Sur « Départ » (1999) sonnent comme de véritables dramaturgies musicales. L’influence des arts visuels et de la poésie est sensible : l’œuvre de Giacometti est évoquée dans Figura - Zyklus, Frammento (1997) et la poésie de Rimbaud est présente dans de nombreuses pièces qui cherchent à rendre la couleur sonore de la langue française et le style du poète. Le compositeur qualifie sa musique de « Sprach-musiken », mettant ainsi en valeur l’aspect dramatique de son œuvre et le pouvoir déclamatif qu’il donne au son. En 2009, il compose Songs from
En 2008, Pierre Boulez et le Chicago Symphony Orchestra créent Osiris. De ces œuvres récentes, citons aussi le cycle pour cordes, de la pièce pour violon seul Study III for Treatise on the Veil au quatuor à cordes Study IV for Treatise on the Veil (2009), une pièce pour pour chœur mixte a cappella she-cholat ahavat ani (2008) et le cycle Sonic eclipse composé de trois concertos pour cuivres celestial object I pour trompette et ensemble, celestial object II, pour cor et ensemble (2009) et Occultation pour cor, trompette et ensemble (2010). En avril 2013, son œuvre Hérodiade-Fragmente est interprétée par l'Orchestre philharmonique de Vienne au Musikverein de Vienne sous la direction de Christoph Eschenbach.
Depuis 2007, Matthias Pintscher est professeur de composition à l'École Supérieure de Musique et Théâtre de Munich et directeur artistique de l’Atelier de Heidelberg au festival Printemps de Heidelberg (Heidelberger Frühling). Il mène aussi une importante activité de chef d’orchestre, appelé dans le monde entier à diriger des orchestres et ensembles des plus renommés (BBC Symphony Orchestra, The Cleveland Orchestra, Ensemble Contrechamps, Ensemble Modern, Klangforum Wien, Museumorchester Frankfurt, NDR Sinfonierorchester, Radio-Sinfonieorchester Stuttgart).
Après une résidence auprès de l'orchestre symphonique de la Radio de Saarbrücken en 2006-2007, puis à la Philharmonie de Cologne en 2007-2008 et auprès de l'orchestre symphonique de la radio de Stuttgart en 2008-2009, il s'installe à New York. En 2012, l'Ensemble intercontemporain le nomme directeur musical, poste qu'il occupe à partir de la saison 2013-2014. En 2014, il est nommé professeur de composition à la Juilliard School.