Ayant composé dès son enfance, Martin Derungs quitte l'école pour étudier, à Zürich et à Bâle, l'orgue, le piano et la théorie. De 1967 à 1971, il suit à Munich les cours de Günter Bialas, grâce à une bourse du Deutscher Akademischer Austauschdienst. De 1980 à 1984, il occupe un poste de professeur de clavecin, basse chiffrée et musique de chambre à la Staatliche Hochschule für Musik de Karlsruhe. De 1978 à 1987, il compose les programmes de l'audacieux Musikkollegium Zürcher Oberland, préside de 1979 à 1984 la Coopérative des musiciens suisses et siège de 1980 à 1989 au conseil de la fondation Foyer des artistes de Boswil. En 1993, il est élu président de l'Association Suisse des Musiciens. Comme interprète, Martin Derungs fait une carrière internationale. De 1964 à 1978, il est membre de l'ensemble Ricercare dirigé par Michel Piguet. Depuis 1975, il est le claveciniste attitré et le fréquent soliste de la Camerata Zurich. En 1986, il fonde l'ensemble baroque Il Piacere. Il a créé, à Witten et Donaueschingen, entre autres, des oeuvres de Paul-Heinz Dittrich, Salvatore Sciarrino et Brian Ferneyhough. Ce contact permanent avec la musique ancienne et contemporaine a des répercussions fécondes sur son travail de compositeur.