Fernando Garnero commence la pratique musicale dès l’enfance dans le domaine des musiques populaires. Après des études à l’université de Buenos Aires (théorie musicale, composition, piano), il quitte l’Argentine en 1998 pour s’installer en Suisse où il étudie le clavecin, la basse continue et la théorie musicale de la Renaissance à l’époque baroque, et de composition au Conservatoire de Genève dans la classe d’Éric Gaudibert (diplôme obtenu ave Mention Très bien). Il y travaille l’orchestration avec Xavier Dayer et l’esthétique musicale du XXe siècle avec Philippe Alberà. Entre 1999-2001, Il intègre également les classes de Thomas Kessler et Hans-Peter Kyburz à Bâle et obtient son diplôme avec mention «Très Bien» à Strasbourg (2004-2007) dans la classe d’Ivan Fedele.

Plusieurs rencontres jalonnent sa formation, entre autres, celles d’Helmut Lachenmann, Brian Ferneyhough, Georges Aperghis, Gérard Pesson. Ses compositions sont jouées par des ensembles tels Accroche Note, Contrechamps, SIC, Sillages, Cairn, Vortex, Solistes de Lyon, et sont entendues dans plusieurs festivals Musica, Archipel, MIA, Voix nouvelles, Voix de Prieuré, Centre Acanthes. Fernando Garnero reçoit des commandes de la part des fondations Royaumont, Liechti, Nestlé pour l’Art, Nicati de Luze, Voix de Prieuré et du ministère français de la Culture et des bourses de l’état de Genève et de la Fondation Patiño. En 2008-2009 il participe au cursus de composition et informatique à l’Ircam.