Né à Lourdes, Christian Zanési commence sa formation musicale à l'université de Pau avec Marie-Françoise Lacaze et Guy Maneveau, et la poursuit au Conservatoire de Paris avec Pierre Schaeffer et Guy Reibel. En 1977 il entre au Groupe de Recherches Musicales (GRM). Il y pratique tous les métiers du son et multiplie les expériences, les réalisations et les rencontres. Il a écrit entre autres : Eclisses (1978), La Nuit Rebis (1979), Trois devinettes à écouter pendant l'orage (1980), Arkheion, Les mots de Stockhausen (1995), Toto Valse (1996), ainsi que pour le cinéma (bande-son des longs-métrages d'animation de René Laloux) et pour le théâtre (musiques des spectacles de François Joxe).

Il est à l'origine de nombreux projets dans les domaines de la radio, des publications et des manifestations musicales, notamment : l'émission Electromania sur France Musique, le festival Présences électronique et les coffrets CD Archives GRM, Bernard Parmegiani, l'œuvre musicale, Luc Ferrari, l'œuvre électronique. Christian Zanési est co-fondateur de l'association Ars Sonora, qui a pour but la diffusion et l'illustration des musiques électroacoustiques, et qui fait notamment paraître une revue électronique trimestrielle, Ars Sonora Revue. Depuis les années 1990, il compose dans son home studio et puise son inspiration dans la rencontre poétique avec des sons remarquables. Il est aujourd'hui le directeur adjoint du GRM de l'Ina.